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People

by Integrating Experimental Data into Biomolecular Simulations
Dr. Jakob Rosenbauer (2021), Multiscale Modeling of Tumor Development
Dr. Mehari Zerihun (2021), RNA Structure Prediction Guided by Co-Evolutionary Information – Method Development and Applications
Dr. Momin Ahmad (2020), 
[…]
Integrating Experimental Data into Biomolecular Simulations
Dr. Jakob Rosenbauer (2021), Multiscale Modeling of Tumor Development
Dr. Mehari Zerihun (2021), RNA Structure Prediction Guided by Co-Evolutionary Information – Method Development and Applications
Dr. Momin Ahmad (2020), High-Throughput
[…]

People
Head
Alexander Schug
PhD Students
Eric Behle (FZJ)
Eric continues Jakob's work on large-scale tissue simulations using cellular Potts models. His current focus lies in understanding emergent properties during tumor growth. As a member of the
https://www.scc.kit.edu/en/aboutus/9214.php
21.09.2021
 Scientific Computing Center (SCC) → About us → Organisation → Departments & Research Groups → Research Group Multiscale Biomolecular Simulation → People

News

joined our group as PhD students at Forschungszentrum Jülich. Welcome! Find more information about their projects here .
May '21
Mehari and Jakob successfully defended their PhD theses. Congratulations!
Jan '21
Marie and Alex got the article The trimeric major capsid
[…]

News
Jul '21
Marie successfully defended her PhD thesis. Congratulations!
Marie and Alex got the article Dynamic particle swarm optimization of biomolecular simulation parameters with flexible objective functions published in Nature Machine Intelligence.
Jun '21
Eric and Christian
https://www.scc.kit.edu/en/aboutus/8896.php
07.09.2021
 Scientific Computing Center (SCC) → About us → Organisation → Departments & Research Groups → Research Group Multiscale Biomolecular Simulation → Recent News

Software

backgrounds.
pydca can be obtained from GitHub  or from the Python Package Index under the MIT License.
See also Zerihun, M. B., Pucci, F., Peter, E. K., & Schug, A. (2020). pydca v1. 0: a comprehensive software for Direct Coupling
[…]

Software
Here you can find an overview of software packages developed in our group.
eSBMTools
eSBMTools is a Python 2.7 package that assists in the setup and evaluation of structure-based simulations of proteins and nucleic acids, both at
https://www.scc.kit.edu/en/aboutus/8900.php
08.09.2021
 Scientific Computing Center (SCC) → About us → Organisation → Departments & Research Groups → Research Group Multiscale Biomolecular Simulation → Software

Person days

Person days
Recording of person days
Under this tile you have the possibility to record person days (only in the large-scale research responsibilities). Further information incl. instructions can be found on the FIMA web pages at:
https://www.fima.kit.edu/435.php
To
https://www.scc.kit.edu/en/services/16679.php
25.01.2024
 Scientific Computing Center (SCC) → Services → Working environment → Enterprise Applications (SAP, Campus Management) → UP - User Portal for SAP applications → Person days

Personen

Personen
Personendetailseiten werden in der Regel über eine Personenliste angelegt und können dann bearbeitet werden:
Beispiel Personendetailseite
Personendaten
[…]

Personen
Personendetailseiten werden in der Regel über eine Personenliste angelegt und können dann bearbeitet werden:
Beispiel Personendetailseite
Personendaten können auf zwei Arten eingetragen werden:
durch Einlesen aus dem SCC-Self-Service-Portal (empfohlen)
durch händische Eingabe in der
https://www.scc.kit.edu/wsm/personen.php
06.11.2023
 Web Site Management → Handbuch → Content-Klassen → Bausteine für Inhalte → Personen

Kontaktbox

Kontaktbox
Sollen Funktionsadressen oder Personen als Kontakte benannt werden, dann bietet sich die Kontaktbox an.
Dabei werden entweder Personendaten einer bereits im Webseitenprojekt vorhandenen Person
[…]

Kontaktbox
Sollen Funktionsadressen oder Personen als Kontakte benannt werden, dann bietet sich die Kontaktbox an.
Dabei werden entweder Personendaten einer bereits im Webseitenprojekt vorhandenen Person verwendet (empfohlen) oder, unabhängig davon, Personendaten händisch eingetragen.
In einer Kontaktbox können eine oder
https://www.scc.kit.edu/wsm/kontaktbox.php
10.01.2022
 Web Site Management → Handbuch → Content-Klassen → Bausteine für Inhalte → Kontaktbox

Inhaltsübersicht

Inhaltsübersicht
Kein Inhalt :-(
sprungmarken_marker_13387
ENTWURF: Deprovisionierung von Datendiensten
Unter dem Deprovisionierungsprozess für Datendienste versteht das SCC die Abwicklung von Aufträgen im Bereich der Datenhaltungsdienste. Dieser Prozess beschreibt die Regelung zur endgültigen Löschung von Daten für diese zentralen Datendienste.
https://www.scc.kit.edu/dienste/13358.php
28.02.2024
 

Listen

Datum, Text, Link.
News: nimmt die News aus der Homepage-Box auf und ermöglicht auf diese Weise ein Newsarchiv.
Personen: Personen- und Kontaktdaten. Daten können aus dem Kommunikationsverzeichnis ausgelesen werden.
Projekte: Beschreibung Forschungsprojekte, Titel, Ansprechperson, Projektguppe, Förderung, Projektbeteiligte,
[…]

Listen
Für strukturierte Inhalte gibt es in OpenText Listen, die Detailseiten des entprechenden Typs aufnehmen können. Z. B. gibt es eine Personenliste mit einer Zeile für jede Person. Bei Klick auf eine Person wird die entsprechende Personendetailseite aufgerufen. Liste
https://www.scc.kit.edu/wsm/listen.php
03.02.2022
 Web Site Management → Handbuch → Seitenbearbeitung → Listen

DFN Order

DFN Order
Translated with DeepL.com
Rules of Use for the Interaction of Users of DFN Communication Services
- adopted by the Executive Board of the Association for the Promotion of a German Research Network (DFN-Verein) on 16.05.1994 and amended
https://www.scc.kit.edu/en/aboutus/177.php
05.03.2024
 Scientific Computing Center (SCC) → Services → General → Terms & Conditions → I&C Regulations → DFN Order

Datendienste - Auswahl nach Spezifikationen

Hochschulen in Baden-Württemberg, der es den Nutzenden ermöglicht, Daten zwischen verschiedenen Computern und mobilen Endgeräten zu synchronisieren bzw. unter teilnehmenden Personen auszutauschen.
zum Dienst
S3 Storage
Speicherkapazität: klein (< 10 TB), mittel (> 10 TB < 1 PB)
Datenschutz:
[…]

Datendienste - Auswahl nach Spezifikationen
Wählen Sie einen der vier unten aufgeführten Anwendungsfälle, um eine erste Auswahl von Datendiensten zu bekommen. Mit den Funktionsfiltern können Sie weitere Spezifikationen wählen, um den dann für Sie passenden Dienst zu finden. Reine
https://www.scc.kit.edu/dienste/17037.php
29.02.2024
 Scientific Computing Center (SCC) → Dienste → Arbeitsumgebung → Daten (Speichern, Teilen, Verwalten)

Treffer: 1-10 von 447